La résistance aux antibiotiques résulte de l’exposition d’un microbiote à une pression de sélection exercée par des agents antimicrobiens.
Cette situation favorise la multiplication des souches les moins sensibles puis leur éventuelle dissémination dans l’environnement qui devient alors un réservoir à partir duquel de nouveaux individus pourront se coloniser.
Chez l’homme, le microbiote intestinal est le plus important réservoir puisqu’il contient 1011 à 1012 bactéries par gramme de selles, appartenant à environ 1 000 espèces différentes.
À chaque fois que l’on utilise des antibiotiques, on favorise la survie et la multiplication de souches qui n’y sont naturellement pas sensibles ou qui ont acquis un mécanisme de résistance vis-à-vis de ces molécules. Vu les niveaux d’antibiotiques produits et consommés de nos jours (des centaines de milliers de tonnes par année dans le monde), la probabilité de faire émerger et disséminer de nouveaux mécanismes de résistances au sein d’espèces pathogènes pour l’homme n’a jamais été aussi forte.
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